El programa de Especialidad en Periodoncia fue aprobado por el Consejo Universitario en el año 2004 e inició actividades en la ciudad de Tijuana en febrero de 2023. Su propósito es responder a la creciente necesidad de atención periodontal en la comunidad que acude a las clínicas de la Facultad de Odontología de la Universidad Autónoma de Baja California.

La especialidad tiene una duración de cuatro semestres (dos años) y se cursa en modalidad escolarizada (tiempo completo). Se rige por los estatutos y normas de la UABC, lo que garantiza su adecuado funcionamiento y el compromiso institucional con la calidad académica.

Además, reconocido por el Consejo Mexicano de Periodoncia el cual es un organismo legal y autónomo que reconoce la calidad de posgrados de periodoncia en el territorio nacional mexicano de acuerdo con los criterios esenciales para evaluar planes y programas de estudio de la especialidad en periodoncia establecidos por la Secretaria de Salud, Secretaria de Educación Publica y la Comisión Interinstitucional para la Formación de Recursos Humanos para la Salud.